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Small RNA 测序
        Small RNA是生物体内重要的调控因子,主要功能是诱导基因沉默,调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物过程。基于新一代高通量测序平台,一次可获得数百万条Small RNA序列,可以发掘、鉴定并定量出任何物种全基因组水平的Small RNA图谱、新miRNA分子的挖掘、靶基因的预测和鉴定以及样品间差异表达分析等科学应用。
 
一、服务内容和特点
      1、测序
        对客户提供的小分子RNA(或总 RNA)进行样品检测,样品检测合格后进行测序。得到原始数据5M Reads。
      2、基本数据处理
        基本信息分析包括:Basecalling、去载体、去污染及sRNA的长度分布。
      3、生物信息分析内容
        数据产出统计
        长度分布
        与参考序列比对信息
        与miRNA数据库比对,鉴定miRNA信息
        与rRNA比对
        鉴定与重复序列相关的Small RNA
        与mRNA、exon、intron比对信息
        Small 分类注释
        预测新的miRNA
        差异表达分析
        miRNA靶基因预测
        注:如客户选择的服务项目,在测序单价基础上加收15%的信息分析费
      4、技术特点
        高通量:一次测序得到500万条序列。
        高质量:在超过6个数量级的动态范围内实验精确的序列检测。
        高通用:无需预先了解序列二级结构,可分析任何物种任何样品。
 
二、技术路线
 
 
三、样品要求
        Total RNA:浓度≥400ng/ul,总量≥30ug;OD260/280为1.8-2.2,28S/18S≥1.5,RIN≥8(哺乳动物)。
        运输条件:Trizol或DEPC水溶解,置于1.5ml离心管中,封口膜密封,干冰冷藏运输。
 
四、价格周期
        20000.00元/样品,周期3个月。
        大量样本请具体咨询。
 
五、提供结果
        原始测序数据。
        项目完成报告。
        生物信息分析结果(如有)。
   

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