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全基因组重测序
全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序,并在个体或者群体水平进行差异性分析的方法,随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升,再加上已知基因组序列的物种增多,全基因组重测序已成为动植物分子育种研究中最为迅速有效的方法。我公司利用新一代高通量测序平台,将不同插入片段文库和双末端测序相结合,可更全面的挖掘基因序列差异和结构变异,具有重要的科研和产业价值。
 

一、服务内容
1、样品制备和测序
▲对客户提供的基因组DNA样品进行检测;
▲合格后进行合适的文库制备;
▲上机测序。
2、生物信息分析
▲数据产出统计:测序深度分布以及覆盖度分布;
▲一致性序列组装:根据和参考基因组序列的比对,组装出该个体基因组的一致序列;
▲SNP检测及分布:得到可信度较高的SNP数据集,并根据已有数据库对SNP进行注释;
▲In/Del检测及分布:和参考序列进行Paired-end比对,检测可信的短In/Del;
▲结构变异检测及分布:目前能检测缺失、插入、复制、倒位、易位等。
 

二、样品要求
基因组DNA:总量≥20ug,浓度≥50ng/ul,OD260/280在1.8-2.0之间,无蛋白质、RNA污染,电泳检测主带清晰无弥散。
运输:超纯水溶解,置于1.5ml离心管中,封口膜密封管口,冰袋冷藏快递。
 

三、价格周期
25000.00元/Gb数据,每个样本最少测序量为1Gb。
周期3个月。
 

四、提供结果
▲原始测序数据。
▲项目完成报告。
▲生物信息分析结果(如有)。
 
五、技术路线(以Illumina GAII为例)

   

北京华大中生科技发展有限公司
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