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数字化基因表达谱测序

数字化基因表达谱是对每一个转录本3’端一段特定的21bp标签序列进行测序,新一代高通量测序平台一次可得到数百万条标签序列,能够全面、经济、快速地检测某物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。由于不需要预先对已知序列设计探针,能够直接用于任何物种的全基因组表达谱分析,在检测未知转录本,稀有转录本以及反义转录本等方面具有非常明显的优势。

 


一、服务内容及特点

1、测序

对客户提供的Total RNAmRNA样品进行检测,合格后进行样品制备,然后测序。

2、基本数据处理

基本数据处理包括:碱基识别、过滤接头序列、检测可能的样品污染、数据产出统计等。

3、生物信息分析

实验重复性分析

测序饱和度分析

表达量分布统计

差异表达基因的检测

反义基因的注释

新转录本的检测

差异基因表达模式聚类分析

Gene Ontology功能显著性富集分析

Pathway显著性富集分析

注:如客户选择以上的服务项目,在测序单价基础上加收15%的信息分析费

4、技术特点

数字化:通过测序直接获得序列,无噪音,无交叉,大大提高分析准确度。

可重复:数据准确,重复性可达98%以上。

高灵敏:能够检测出低丰度的表达基因。

高通量:一次可产生500万条数据,检测10-30万种序列标签。

高通用:不依赖已知基因,可检测新转录本和反义链转录本。

 


二、技术路线

 


三、样品要求

Total RNA:浓度≥400ng/ul,总量≥15ugOD260/2801.8-2.2,28S/18S1RIN8

运输条件TrizolDEPC水溶解,置于1.5ml离心管中,封口膜密封,干冰冷藏运输。

 


四、价格周期

15000.00元/样品,周期3个月。

大量样品请具体咨询。

 


五、提供结果

原始测序数据。

项目完成报告。

生物信息分析结果(如有)。

   

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