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新一代测序平台技术服务概述

随着新一代测序技术的飞速发展,测序成本和时间都较传统Sanger方法大大降低,使得基因组测序、转录组测序、表达谱测序等研究迎来新的飞跃,并渐入佳境。我公司引进四种主流的高速测序系统:Genome Sequencer FLX (Roche公司)Applied Biosystems SOLID 4.0 (ABI公司) Illumina Genome Analyzer GA IIHiSeq2000(Illumina公司),并利用这三种系统开展各种高速序列解析服务。

 

 

各种测序平台比较:

 

 

 

454 GS FLX

SOLID

Illumina GA II

3730xl

测序长度

300~400 base

50 base

75 base

600~1,000 base

数据总量

400 Mb/run

10~20 Gb/run

6~12 Gb/run

80 Kb/run

Reads/Run

100 万

数亿

1~2 亿

96

测序周期

8 hour

5~10 day

2.5~5 day

1 hour

准确率

99.50%

99.94%

98.50%

>99.99%

难测序列

Homo polymer

GC含量高的

N/A

Homo polymer

输出的序列形式

FASTA

csFASTA

FASTA

FASTA

应用

基因组测序,转录组测序

Re-sequence

ChIP-seq,MicroRNA测序,转录组测序,基因组重测序

PCR产物测序,质粒测序

实验周期

1 个月

2 个月

1 个月

3 天

 

   

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