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细菌基因组完成图构建【Gap Close】

由于新一代测序技术的发展,测序成本大大降低,目前细菌等微生物测序进展迅猛,数据库中已有超过2000株细菌及古细菌测序完毕,并且更多的细菌基因组测序正在计划中或者进行中。

目前数据库中的序列多为精细图,但对于具有代表性的重要菌株来说,得到完成图显得尤为重要。我公司独自完成了多株沙门氏杆菌、蓝藻等等的微生物全基因组测序,而且数据全部达到完成图标准,赢得了客户的好评,并逐渐形成了特色服务。


一、技术路线

 



二、服务内容

精细图标准:基因组覆盖度大于95%,基因区域覆盖度不少于98%,单个碱基错误率低于十万分之一。

完成图标准:完整的基因组序列,覆盖100%基因组,单碱基错误率低于十万分之一。一般在精细图基础上构建。

技术方案PCR扩增,PCR产物测序。

 

 


三、样品要求

客户需提供足量的基因组DNA,或者直接提供菌株,由我们来提取DNA

 

 


四、价格周期

300.00元/gap(低质量区视同gap)。

周期根据gap和低质量区数量而定。

 

 

 


五、提供结果

 

1、完整的实验流程报告。

2、免费数据分析

Ø  原始数据统计

Ø  覆盖度计算

Ø  编码基因预测

Ø  常见内切酶切点分析

3、收费数据分析

Ø  COG分类

Ø  KEGG通路分析

Ø  比较基因组分析和基因家族分析

   

北京华大中生科技发展有限公司
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